Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClmQ7TSN2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ClmQ7TSN2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms