Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ckap2lQ7TS74 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms