Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sys1Q78S06 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sys1Q78S06 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Sys1Q78S06 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Sys1Q78S06 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Sys1Q78S06 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Sys1Q78S06 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Sys1Q78S06 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Sys1Q78S06 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Sys1Q78S06 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sys1Q78S06 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sys1Q78S06 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sys1Q78S06 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms