Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim12Q78RX3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms