Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed3Q78IS1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmed3Q78IS1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms