Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GypcQ78HU7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms