Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SynmQ70IV5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SynmQ70IV5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms