Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2r2Q6ZWZ2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2r2Q6ZWZ2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2r2Q6ZWZ2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ube2r2Q6ZWZ2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ube2r2Q6ZWZ2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ube2r2Q6ZWZ2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ube2r2Q6ZWZ2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms