Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms