Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cnih3Q6ZWS4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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