Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup188Q6ZQH8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nup188Q6ZQH8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms