Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LcorQ6ZPI3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms