Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ0

Cd300a, CMRF35-like molecule 8, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300aQ6SJQ0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cd300aQ6SJQ0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd300aQ6SJQ0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms