Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nudcd1Q6PIP5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms