Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HjurpQ6PG16 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms