Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scaf4Q6PFF0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Scaf4Q6PFF0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms