Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sarm1Q6PDS3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sarm1Q6PDS3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sarm1Q6PDS3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sarm1Q6PDS3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sarm1Q6PDS3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sarm1Q6PDS3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sarm1Q6PDS3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sarm1Q6PDS3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sarm1Q6PDS3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sarm1Q6PDS3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sarm1Q6PDS3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sarm1Q6PDS3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sarm1Q6PDS3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sarm1Q6PDS3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sarm1Q6PDS3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sarm1Q6PDS3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sarm1Q6PDS3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sarm1Q6PDS3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sarm1Q6PDS3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sarm1Q6PDS3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sarm1Q6PDS3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sarm1Q6PDS3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sarm1Q6PDS3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sarm1Q6PDS3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sarm1Q6PDS3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sarm1Q6PDS3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sarm1Q6PDS3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sarm1Q6PDS3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sarm1Q6PDS3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sarm1Q6PDS3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sarm1Q6PDS3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sarm1Q6PDS3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms