Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM2

Srsf1, Serine/arginine-rich splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf1Q6PDM2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srsf1Q6PDM2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf1Q6PDM2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms