Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms