Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6PD19 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6PD19 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6PD19 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6PD19 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6PD19 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6PD19 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q6PD19 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q6PD19 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q6PD19 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q6PD19 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q6PD19 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Q6PD19 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q6PD19 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Q6PD19 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q6PD19 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q6PD19 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6PD19 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6PD19 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6PD19 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6PD19 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6PD19 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6PD19 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6PD19 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6PD19 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6PD19 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6PD19 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6PD19 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6PD19 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6PD19 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6PD19 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6PD19 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6PD19 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6PD19 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6PD19 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6PD19 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6PD19 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6PD19 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6PD19 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q6PD19 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6PD19 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6PD19 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6PD19 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6PD19 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6PD19 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6PD19 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6PD19 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6PD19 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6PD19 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6PD19 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6PD19 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6PD19 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6PD19 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6PD19 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q6PD19 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6PD19 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6PD19 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6PD19 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6PD19 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6PD19 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6PD19 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6PD19 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6PD19 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6PD19 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6PD19 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q6PD19 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6PD19 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6PD19 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6PD19 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6PD19 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6PD19 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6PD19 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6PD19 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6PD19 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6PD19 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6PD19 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6PD19 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6PD19 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6PD19 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6PD19 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6PD19 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6PD19 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6PD19 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q6PD19 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6PD19 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6PD19 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6PD19 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6PD19 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6PD19 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6PD19 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6PD19 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6PD19 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6PD19 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q6PD19 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q6PD19 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q6PD19 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q6PD19 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q6PD19 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q6PD19 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q6PD19 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms