Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Herc4Q6PAV2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Herc4Q6PAV2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Herc4Q6PAV2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Herc4Q6PAV2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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