Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AtminQ6P9S1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AtminQ6P9S1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AtminQ6P9S1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AtminQ6P9S1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AtminQ6P9S1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AtminQ6P9S1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AtminQ6P9S1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AtminQ6P9S1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AtminQ6P9S1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AtminQ6P9S1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AtminQ6P9S1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AtminQ6P9S1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AtminQ6P9S1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AtminQ6P9S1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AtminQ6P9S1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AtminQ6P9S1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AtminQ6P9S1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AtminQ6P9S1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AtminQ6P9S1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AtminQ6P9S1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms