Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Z3

Thap4, THAP domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thap4Q6P3Z3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Thap4Q6P3Z3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms