Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Frg2f1Q6P3A2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms