Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E8

Efcab6, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab6Q6P1E8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Efcab6Q6P1E8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Efcab6Q6P1E8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms