Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Colgalt2Q6NVG7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms