Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS69

Amer3, APC membrane recruitment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amer3Q6NS69 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Amer3Q6NS69 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Amer3Q6NS69 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms