Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ParpbpQ6IRT3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ParpbpQ6IRT3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms