Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krt77Q6IFZ6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt77Q6IFZ6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt77Q6IFZ6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt77Q6IFZ6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt77Q6IFZ6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt77Q6IFZ6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt77Q6IFZ6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt77Q6IFZ6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt77Q6IFZ6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt77Q6IFZ6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt77Q6IFZ6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt77Q6IFZ6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt77Q6IFZ6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt77Q6IFZ6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt77Q6IFZ6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt77Q6IFZ6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt77Q6IFZ6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt77Q6IFZ6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt77Q6IFZ6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms