Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Best3Q6H1V1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Best3Q6H1V1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms