Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Edrf1Q6GQV7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Edrf1Q6GQV7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Edrf1Q6GQV7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Edrf1Q6GQV7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Edrf1Q6GQV7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Edrf1Q6GQV7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Edrf1Q6GQV7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Edrf1Q6GQV7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Edrf1Q6GQV7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Edrf1Q6GQV7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Edrf1Q6GQV7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Edrf1Q6GQV7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms