Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scaf8Q6DID3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scaf8Q6DID3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms