Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nop58Q6DFW4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms