Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ctnna3Q65CL1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctnna3Q65CL1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms