Protein–RNA interactions for Protein: Q64253

Ly6e, Lymphocyte antigen 6E, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6eQ64253 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ly6eQ64253 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6eQ64253 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms