Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
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Ccdc18Q640L5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc18Q640L5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ccdc18Q640L5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc18Q640L5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc18Q640L5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc18Q640L5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc18Q640L5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc18Q640L5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc18Q640L5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc18Q640L5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc18Q640L5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc18Q640L5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
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Ccdc18Q640L5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
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Ccdc18Q640L5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
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Ccdc18Q640L5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
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Ccdc18Q640L5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
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Ccdc18Q640L5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc18Q640L5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
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