Protein–RNA interactions for Protein: Q62521

Zic3, Zinc finger protein ZIC 3, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic3Q62521 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zic3Q62521 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic3Q62521 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Zic3Q62521 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic3Q62521 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic3Q62521 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zic3Q62521 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic3Q62521 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic3Q62521 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zic3Q62521 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic3Q62521 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zic3Q62521 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic3Q62521 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic3Q62521 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic3Q62521 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zic3Q62521 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zic3Q62521 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic3Q62521 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic3Q62521 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic3Q62521 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic3Q62521 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zic3Q62521 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic3Q62521 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic3Q62521 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zic3Q62521 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zic3Q62521 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zic3Q62521 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic3Q62521 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zic3Q62521 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic3Q62521 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zic3Q62521 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic3Q62521 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zic3Q62521 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic3Q62521 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zic3Q62521 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zic3Q62521 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zic3Q62521 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic3Q62521 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic3Q62521 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic3Q62521 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic3Q62521 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zic3Q62521 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic3Q62521 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zic3Q62521 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic3Q62521 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic3Q62521 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Zic3Q62521 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic3Q62521 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zic3Q62521 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic3Q62521 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zic3Q62521 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zic3Q62521 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zic3Q62521 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zic3Q62521 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zic3Q62521 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zic3Q62521 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zic3Q62521 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zic3Q62521 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zic3Q62521 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zic3Q62521 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Zic3Q62521 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Zic3Q62521 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zic3Q62521 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zic3Q62521 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zic3Q62521 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zic3Q62521 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zic3Q62521 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zic3Q62521 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zic3Q62521 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zic3Q62521 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic3Q62521 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic3Q62521 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic3Q62521 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic3Q62521 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zic3Q62521 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic3Q62521 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic3Q62521 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zic3Q62521 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zic3Q62521 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zic3Q62521 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Zic3Q62521 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zic3Q62521 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic3Q62521 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic3Q62521 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zic3Q62521 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zic3Q62521 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic3Q62521 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic3Q62521 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms