Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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Lcn4Q62472 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Lcn4Q62472 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Lcn4Q62472 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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Lcn4Q62472 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn4Q62472 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms