Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vat1Q62465 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms