Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

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Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sema3cQ62181 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Sema3cQ62181 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Sema3cQ62181 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Sema3cQ62181 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema3cQ62181 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms