Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RhocQ62159 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhocQ62159 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhocQ62159 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhocQ62159 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhocQ62159 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhocQ62159 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhocQ62159 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RhocQ62159 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RhocQ62159 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RhocQ62159 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RhocQ62159 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhocQ62159 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhocQ62159 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhocQ62159 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhocQ62159 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhocQ62159 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhocQ62159 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhocQ62159 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhocQ62159 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhocQ62159 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhocQ62159 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhocQ62159 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhocQ62159 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhocQ62159 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RhocQ62159 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhocQ62159 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RhocQ62159 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhocQ62159 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhocQ62159 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhocQ62159 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhocQ62159 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhocQ62159 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhocQ62159 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhocQ62159 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhocQ62159 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhocQ62159 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhocQ62159 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhocQ62159 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhocQ62159 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RhocQ62159 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhocQ62159 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhocQ62159 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RhocQ62159 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms