Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sin3bQ62141 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms