Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Gm42822-201ENSMUST00000200507 1529 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Prm3Q62100 Gm3159-203ENSMUST00000177764 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Prm3Q62100 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Tprkb-202ENSMUST00000089570 1216 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prm3Q62100 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Prm3Q62100 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
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