Protein–RNA interactions for Protein: Q61830

Mrc1, Macrophage mannose receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrc1Q61830 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrc1Q61830 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrc1Q61830 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrc1Q61830 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrc1Q61830 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrc1Q61830 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms