Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itga7Q61738 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itga7Q61738 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms