Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msi1Q61474 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msi1Q61474 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Msi1Q61474 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms