Protein–RNA interactions for Protein: Q61329

Zfhx3, Zinc finger homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 3,726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx3Q61329 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfhx3Q61329 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfhx3Q61329 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Zfhx3Q61329 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfhx3Q61329 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Zfhx3Q61329 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfhx3Q61329 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfhx3Q61329 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfhx3Q61329 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Zfhx3Q61329 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zfhx3Q61329 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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Zfhx3Q61329 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfhx3Q61329 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfhx3Q61329 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfhx3Q61329 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Zfhx3Q61329 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Zfhx3Q61329 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Zfhx3Q61329 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfhx3Q61329 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zfhx3Q61329 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Zfhx3Q61329 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfhx3Q61329 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfhx3Q61329 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfhx3Q61329 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfhx3Q61329 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfhx3Q61329 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Zfhx3Q61329 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfhx3Q61329 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zfhx3Q61329 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Zfhx3Q61329 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Zfhx3Q61329 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfhx3Q61329 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfhx3Q61329 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Zfhx3Q61329 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfhx3Q61329 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zfhx3Q61329 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Zfhx3Q61329 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Zfhx3Q61329 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Zfhx3Q61329 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfhx3Q61329 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Zfhx3Q61329 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zfhx3Q61329 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfhx3Q61329 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfhx3Q61329 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Zfhx3Q61329 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfhx3Q61329 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfhx3Q61329 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfhx3Q61329 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfhx3Q61329 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfhx3Q61329 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfhx3Q61329 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfhx3Q61329 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfhx3Q61329 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfhx3Q61329 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfhx3Q61329 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfhx3Q61329 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfhx3Q61329 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms