Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfap2bQ61313 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tfap2bQ61313 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms