Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

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Length 930 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Trpc6Q61143 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
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Trpc6Q61143 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Trpc6Q61143 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Trpc6Q61143 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Trpc6Q61143 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Trpc6Q61143 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Trpc6Q61143 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Trpc6Q61143 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Trpc6Q61143 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Trpc6Q61143 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Trpc6Q61143 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Trpc6Q61143 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpc6Q61143 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Trpc6Q61143 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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