Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Foxd3Q61060 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms